Основными направлениями работы конференции были:
Российское казачество и революционные события 1905–1907 гг.;
Факторы и причины антиреволюционных настроений в казачьем социуме после событий октября 1917 года;
Расказачивание как социальный феномен;
Насильственное расказачивание в годы Гражданской войны;
Специфика проявления «латентного расказачивания» после Гражданской войны;
Проблема расказачивания в исторической памяти российского народа;
Взаимодействие казачества России с белым движением в период Гражданской войны;
Красное казачество в годы Гражданской войны;
Изменение жизненного уклада казачьих общин после окончания Гражданской войны;
Казачий коллаборационизм в годы Великой Отечественной войны как продолжение гражданского противостояния 1917–1922 гг.;
Казачье движение в период «поздней перестройки» и в постсоветский период. Казаки в событиях 1991–1993 гг.;
Деятельность российских казачьих структур после 1991 г.: проблемы и перспективы.